8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4434 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4434  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  83.33 
 
 		 239 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  44.02 
 
 		 246 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  41.88 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  41.44 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  23.71 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  22.99 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>