21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0294 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4434  hypothetical protein  83.33 
 
 
221 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  41.42 
 
 
257 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  42.73 
 
 
246 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  40.74 
 
 
258 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  22.91 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  23.85 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  24.27 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  24.07 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  24.07 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  24.27 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  23.85 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  24.32 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  24.32 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  24.2 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  22.16 
 
 
238 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  22.16 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  22.16 
 
 
238 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  22.82 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2311  hypothetical protein  23.94 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  24.02 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0419123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>