24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0318 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  99.1 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  99.1 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  99.55 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  99.55 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  99.1 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  98.65 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  66.02 
 
 		 222 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0315  hypothetical protein  30.1 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0440166  hitchhiker  0.00820963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00248  hypothetical protein  30.1 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00251  hypothetical protein  30.1 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3315  conserved hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3330  hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0299  hypothetical protein  29.59 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  31.84 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0335  hypothetical protein  29.78 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218104  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  27.2 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  24.89 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  24.66 
 
 		 258 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  26.44 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  28.93 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  26.58 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  25.71 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  25.71 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>