More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0403 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0403  cytidylate kinase  100 
 
 		 213 aa  433  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0616  cytidylate kinase  80.37 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  36.71 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  36.79 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  37.62 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  35.94 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  37.32 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  37.27 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  36.7 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  36.54 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  36.79 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  37.27 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  36.82 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  35.98 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  35.98 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  34.85 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  35.98 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  36.82 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  37.39 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1588  cytidylate kinase  36.36 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000460348  hitchhiker  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  36.82 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  34.13 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  36.94 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  38.1 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  36.24 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  35.98 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  36.28 
 
 		 226 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  36.28 
 
 		 226 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  33.19 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  37.14 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  35.85 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  37.14 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  31.3 
 
 		 243 aa  124  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  36.36 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  36.89 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  32.23 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  35.59 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  35.11 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  34.22 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  34.22 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  34.22 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  34.22 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  34.22 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  34.22 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  34.22 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  35.5 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  34.22 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  34.22 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  34.82 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  35.53 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  33.18 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  32.08 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.65 
 
 		 529 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  33.78 
 
 		 227 aa  121  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  36.71 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  35.11 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  34.83 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  35.11 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  35 
 
 		 705 aa  121  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  35.11 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  35.11 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  35.05 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  35.11 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  35.14 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  35.14 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  34.36 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  35.05 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  34.33 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  35.05 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  35.05 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  35.45 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  35.05 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  34.67 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  35.32 
 
 		 670 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  36.1 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  32.02 
 
 		 227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  35.02 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  34.7 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  33.48 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  34.85 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  37.02 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  34.42 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  34.8 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  32.85 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  33.18 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  30.81 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  34.6 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  32.61 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  33.67 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  37.81 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  33.91 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  35.96 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  33.81 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  34.4 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  34.1 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>