28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_A0019 on replicon NC_011351
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011351  ECH74115_A0019  repeated sequence found in lipoprotein LPP  100 
 
 		 540 aa  1026    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1950  hypothetical protein  27.85 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000156547  normal  0.0548369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2673  hemagluttinin domain-containing protein  27.34 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2585  putative haemagglutinin/invasin  27.34 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1031  hypothetical protein  29.25 
 
 		 183 aa  67  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.413291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1867  YadA domain-containing protein  33.71 
 
 		 420 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.704815 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2329  conserved hypothetical protein  24.28 
 
 		 227 aa  51.6  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000461934  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1924  hypothetical protein, putative phage gene  28.45 
 
 		 206 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.460525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  25.62 
 
 		 1209 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  32.06 
 
 		 1546 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  34.29 
 
 		 1854 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2286  YadA domain-containing protein  41.38 
 
 		 1584 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0535407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  32.37 
 
 		 599 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  32.06 
 
 		 1471 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  32.06 
 
 		 1471 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  34.29 
 
 		 1434 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  34.29 
 
 		 1353 aa  47.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  32.32 
 
 		 1326 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1951  hypothetical protein  25.74 
 
 		 615 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000838552  normal  0.108368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2672  hypothetical protein  26.41 
 
 		 615 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  38.03 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  34.19 
 
 		 997 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  34.19 
 
 		 815 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2584  hypothetical protein  25.32 
 
 		 615 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.268174  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6299  hemagluttinin domain-containing protein  24.68 
 
 		 654 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  38.81 
 
 		 1916 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  38.81 
 
 		 2025 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  38.81 
 
 		 2757 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>