36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0873 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  100 
 
 		 117 aa  236  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  36.75 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  33.06 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  35.25 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  34.43 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  31.03 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  31.67 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  31.67 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  32.26 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  30.25 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  36.23 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  33.33 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  29.41 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  33.78 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  30.25 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  38.37 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  32.89 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1422  HNH endonuclease  45.24 
 
 		 321 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0138044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  30.83 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  47.5 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  32.35 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0545  gp82  33.73 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.719132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  31.09 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  31.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  37.5 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  30.08 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>