More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3042 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3042  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
322 aa  631  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0847368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1986  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.67 
 
 
328 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1302  heat shock protein DnaJ-like  47.83 
 
 
276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0985  heat shock protein DnaJ domain protein  40.94 
 
 
334 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.564303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1737  heat shock protein DnaJ domain protein  51.7 
 
 
241 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.261222  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2103  heat shock protein DnaJ domain protein  33.79 
 
 
220 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000586336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  55.17 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  55.17 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  46.84 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  52.63 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0040  chaperone protein DnaJ  44.87 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  50 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  53.45 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  42.86 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  53.45 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  53.45 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  53.45 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  52.73 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.72 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  46.58 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  42.5 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  48.28 
 
 
386 aa  65.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
382 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 
386 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  53.45 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  35.11 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  51.79 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  46.58 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
385 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3476  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.29 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00429307  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  52.73 
 
 
387 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.72 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  52.73 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  53.57 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  56.36 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0488  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
400 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  50.85 
 
 
389 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  52.63 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  57.69 
 
 
400 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
378 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
385 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.72 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
382 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  42.25 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  52.63 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  45.68 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  51.92 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
355 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  50.91 
 
 
376 aa  63.2  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  50 
 
 
287 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
387 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  47.37 
 
 
387 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  40.51 
 
 
382 aa  62.8  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  50.88 
 
 
377 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
369 aa  62.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  45.61 
 
 
307 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  32.86 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  46.55 
 
 
373 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.55 
 
 
283 aa  62.8  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
380 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  54.9 
 
 
392 aa  62  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  50 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  34 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  46.55 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  41.67 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  52.63 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  52.63 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.12 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  50.91 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  47.27 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  43.06 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.28 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  39.74 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  48.28 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  48.28 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>