180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2233 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 
629 aa  1279    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  53.21 
 
 
624 aa  684    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  71.22 
 
 
625 aa  914    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.03 
 
 
628 aa  674    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  71.98 
 
 
631 aa  931    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  55.9 
 
 
629 aa  690    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  54.83 
 
 
623 aa  648    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  59.03 
 
 
626 aa  733    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  64.02 
 
 
627 aa  827    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  84.1 
 
 
629 aa  1050    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.87 
 
 
621 aa  691    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.83 
 
 
653 aa  656    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  65.16 
 
 
629 aa  853    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.35 
 
 
645 aa  623  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.66 
 
 
641 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  49.37 
 
 
640 aa  588  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  48.62 
 
 
642 aa  558  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.32 
 
 
635 aa  535  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.01 
 
 
679 aa  530  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.22 
 
 
639 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.75 
 
 
663 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  47.78 
 
 
628 aa  521  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.84 
 
 
663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.3 
 
 
656 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.46 
 
 
635 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.24 
 
 
635 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.99 
 
 
672 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.09 
 
 
674 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.39 
 
 
673 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.33 
 
 
632 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.07 
 
 
674 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.74 
 
 
655 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.11 
 
 
666 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.24 
 
 
670 aa  360  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.4 
 
 
695 aa  356  6.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  37.24 
 
 
669 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.92 
 
 
648 aa  346  8e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.79 
 
 
634 aa  342  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.75 
 
 
679 aa  342  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.07 
 
 
637 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.86 
 
 
707 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.49 
 
 
676 aa  333  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.08 
 
 
663 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.96 
 
 
710 aa  327  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  33.07 
 
 
629 aa  324  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  32.63 
 
 
623 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  32 
 
 
680 aa  290  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  25.97 
 
 
538 aa  70.1  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  29.67 
 
 
557 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  24.53 
 
 
542 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  27.2 
 
 
544 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0447  hydroxylamine reductase  24.29 
 
 
454 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  25.74 
 
 
540 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  25.59 
 
 
547 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  25.59 
 
 
547 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  28.25 
 
 
545 aa  62.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1540  hydroxylamine reductase  23.77 
 
 
442 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0468  hybrid cluster protein  23.17 
 
 
444 aa  62  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000131773  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  27.25 
 
 
557 aa  62  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1803  hydroxylamine reductase  23.89 
 
 
436 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  23.33 
 
 
551 aa  61.6  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  30 
 
 
427 aa  60.8  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3446  hydroxylamine reductase  24.18 
 
 
436 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  27.67 
 
 
552 aa  60.5  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  26.27 
 
 
549 aa  60.1  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1676  hydroxylamine reductase  24.48 
 
 
428 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150263  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  27.89 
 
 
545 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  27.23 
 
 
543 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  22.66 
 
 
555 aa  59.7  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  28.39 
 
 
549 aa  59.3  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  26.17 
 
 
540 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  24.42 
 
 
787 aa  58.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  28.75 
 
 
535 aa  58.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  26.17 
 
 
546 aa  57.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3458  hydroxylamine reductase  23 
 
 
436 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3243  hydroxylamine reductase  23.08 
 
 
428 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  27.55 
 
 
547 aa  57.4  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  26.67 
 
 
537 aa  57.4  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3497  hydroxylamine reductase  23.08 
 
 
428 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  28.57 
 
 
554 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3216  hydroxylamine reductase  23 
 
 
428 aa  57  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3153  hydroxylamine reductase  23.08 
 
 
428 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1634  hydroxylamine reductase  25.56 
 
 
538 aa  57.4  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.228305  normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  28.57 
 
 
554 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  28.57 
 
 
554 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2875  hydroxylamine reductase  23.21 
 
 
548 aa  57  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115588  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  26.49 
 
 
533 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  27.82 
 
 
548 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3151  hydroxylamine reductase  22.84 
 
 
428 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000614247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  26.8 
 
 
533 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  25.1 
 
 
549 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  31.14 
 
 
549 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1125  hydroxylamine reductase  25.75 
 
 
542 aa  55.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000097703  normal  0.234741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  29.63 
 
 
551 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  25.11 
 
 
555 aa  56.6  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  25.39 
 
 
427 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  27.25 
 
 
554 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  26.8 
 
 
533 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  30 
 
 
541 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  29.63 
 
 
552 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>