28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1874 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  100 
 
 		 753 aa  1564    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  29.49 
 
 		 792 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  27.19 
 
 		 771 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  27.94 
 
 		 771 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  26.67 
 
 		 818 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  27.22 
 
 		 767 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  27.54 
 
 		 767 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  25.19 
 
 		 722 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  25 
 
 		 792 aa  146  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  23.65 
 
 		 810 aa  127  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  22.66 
 
 		 803 aa  99.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  28.73 
 
 		 776 aa  91.3  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  24.09 
 
 		 757 aa  78.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  21.35 
 
 		 743 aa  77.4  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  20.74 
 
 		 710 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  27.64 
 
 		 643 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  22.55 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  29.28 
 
 		 717 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  27.18 
 
 		 770 aa  57  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  25.3 
 
 		 721 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  27.35 
 
 		 746 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0699  hypothetical protein  38.18 
 
 		 76 aa  48.5  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  22.41 
 
 		 833 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  22.8 
 
 		 878 aa  45.8  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  31.25 
 
 		 895 aa  45.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3589  hypothetical protein  32.67 
 
 		 728 aa  45.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  24.17 
 
 		 765 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4596  hypothetical protein  32.22 
 
 		 728 aa  44.3  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>