164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0900 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0900  Glucokinase  100 
 
 		 365 aa  705    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1461  glucokinase  48.77 
 
 		 329 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.497227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1958  glucokinase  46.34 
 
 		 354 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0546  Glucokinase  41.94 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.499274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1390  Glucokinase  35.14 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0110243  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  28.01 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  31.82 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  32.6 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  27.42 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  32.89 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  30.96 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  32.05 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  27.63 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  28.37 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  27.63 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  27.3 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  29.4 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  28.57 
 
 		 338 aa  99.4  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  28.45 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  30.67 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  28.77 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  26.19 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  32.33 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  29.56 
 
 		 324 aa  92.8  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  31.69 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  29.49 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0363  glucokinase  30.19 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  30.23 
 
 		 324 aa  91.3  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  30.77 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06521  putative glucokinase  23.87 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  28.73 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  28.73 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  28.73 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  29.38 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  32.68 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  29 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  26.16 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  30.51 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  26.76 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  29.66 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  31.3 
 
 		 319 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  31.88 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  26.06 
 
 		 357 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  23.61 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  30.94 
 
 		 320 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  32.23 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  31.55 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  31.3 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  30.94 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  31.3 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  27.27 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  27.27 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  27.27 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  27.61 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  29.25 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  29.01 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  30.83 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  31.22 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  27.27 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  29.41 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  27.78 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  26.99 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  31.48 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  28.01 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1896  glucokinase  31.39 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  27.86 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  31.09 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  27.17 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  26.87 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  29.59 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  30.45 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1655  glucokinase  29.09 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692782  hitchhiker  0.0000702574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  29.97 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  27.56 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  27.56 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  28.93 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  29.2 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  25.69 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  27.56 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  27.56 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  28.01 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  27.56 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  27.56 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  27.56 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  27.56 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  29.43 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  27.56 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1943  glucokinase  27.32 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  30.11 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  33.43 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  24.44 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48774  glucokinase  25.64 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.985035  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  22.73 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  22.99 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  26.61 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  28.37 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2875  glucokinase  30.64 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  25.49 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  31.64 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  29.61 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>