More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0676 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
374 aa  754    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  52.85 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  67.82 
 
 
453 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  32.2 
 
 
395 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.04 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.13 
 
 
398 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
398 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
380 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  28.9 
 
 
745 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
389 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
399 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.52 
 
 
389 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
377 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
388 aa  135  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.83 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
374 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
361 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  37.67 
 
 
360 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
412 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
379 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.75 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
374 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.37 
 
 
388 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
401 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  39.32 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
364 aa  116  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
376 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
372 aa  116  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.65 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  39.44 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.79 
 
 
366 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
376 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
371 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
360 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
368 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
360 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  39.77 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.88 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.44 
 
 
359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  29.88 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  38.04 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
373 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 
375 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
365 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 
415 aa  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
365 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
367 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  37.06 
 
 
406 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 
366 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.74 
 
 
366 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 
403 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.74 
 
 
366 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 
366 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
386 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
413 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
406 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
378 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
385 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
373 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  26.39 
 
 
366 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
575 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.94 
 
 
745 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
378 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
417 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
367 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
375 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
382 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 
405 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.71 
 
 
409 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
409 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
380 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
412 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
414 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  40.18 
 
 
440 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
384 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1971  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
407 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.341888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>