More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1417 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
205 aa  414  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.67 
 
 
203 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.77 
 
 
211 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.26 
 
 
208 aa  216  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.58 
 
 
206 aa  214  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.5 
 
 
202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.55 
 
 
206 aa  211  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51 
 
 
217 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.25 
 
 
205 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.52 
 
 
206 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.5 
 
 
204 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.25 
 
 
227 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49 
 
 
204 aa  205  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.98 
 
 
206 aa  204  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.25 
 
 
205 aa  204  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.51 
 
 
213 aa  202  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.5 
 
 
206 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.74 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.52 
 
 
202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.24 
 
 
202 aa  197  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.48 
 
 
205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.31 
 
 
225 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.78 
 
 
202 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1486  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.51 
 
 
206 aa  194  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000112239  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.83 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.89 
 
 
239 aa  193  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.83 
 
 
225 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.81 
 
 
194 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
195 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  49.2 
 
 
186 aa  188  4e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
195 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
195 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
195 aa  188  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
195 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
195 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
195 aa  188  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.02 
 
 
200 aa  187  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.53 
 
 
213 aa  187  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.83 
 
 
195 aa  187  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.63 
 
 
216 aa  187  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.37 
 
 
195 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.83 
 
 
195 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.67 
 
 
208 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0417204  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.77 
 
 
313 aa  186  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.46 
 
 
203 aa  185  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.59 
 
 
210 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2533  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.45 
 
 
218 aa  184  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272772  normal  0.391268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.74 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.94 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234419  normal  0.638022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.11 
 
 
195 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0659  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.13 
 
 
219 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.48364 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0641  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.81 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.96 
 
 
208 aa  181  9.000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.147128  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04960  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.44 
 
 
205 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.31 
 
 
195 aa  181  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.85 
 
 
205 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.85 
 
 
205 aa  180  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.69 
 
 
225 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1247  putative phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.61 
 
 
206 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1247  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.09 
 
 
209 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000481744  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
213 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  43.16 
 
 
212 aa  179  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.15 
 
 
228 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.6 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.72 
 
 
410 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367196 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.59 
 
 
218 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.23 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.45 
 
 
223 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2513  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.38 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
225 aa  177  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.11 
 
 
218 aa  177  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.88 
 
 
206 aa  177  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.86 
 
 
212 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.22 
 
 
215 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.85 
 
 
206 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.85 
 
 
222 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45 
 
 
214 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.65 
 
 
198 aa  175  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.11 
 
 
223 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4198  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.13 
 
 
206 aa  175  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0718234  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.44 
 
 
214 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.71 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.33 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.98 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.72 
 
 
187 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.41 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1531  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.83 
 
 
197 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2577  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.21 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.29 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.32 
 
 
216 aa  171  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.2 
 
 
217 aa  171  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.86 
 
 
215 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3462  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.41 
 
 
217 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0737  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
213 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.407866  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.23 
 
 
202 aa  170  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
209 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.61 
 
 
213 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>