More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4900 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
410 aa  826    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.2 
 
 
239 aa  272  9e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.5 
 
 
214 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.74 
 
 
218 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.54 
 
 
214 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.56 
 
 
225 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.33 
 
 
212 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.86 
 
 
209 aa  231  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.779009  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.23 
 
 
230 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0394188  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.77 
 
 
213 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.43 
 
 
250 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.165078 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.11 
 
 
232 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.11 
 
 
232 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1388  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.19 
 
 
186 aa  195  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.73 
 
 
206 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.93 
 
 
204 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.73 
 
 
206 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.69 
 
 
218 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.83 
 
 
204 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.69 
 
 
206 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.9 
 
 
206 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1281  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.2 
 
 
195 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09681  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
218 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.19 
 
 
224 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.21 
 
 
218 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0909  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.69 
 
 
206 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
195 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
195 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
195 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
195 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
195 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.59 
 
 
205 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.49 
 
 
195 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.79 
 
 
211 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.36 
 
 
195 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.36 
 
 
195 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.97 
 
 
195 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.96 
 
 
214 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
222 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.84 
 
 
195 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.21 
 
 
225 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.09 
 
 
213 aa  166  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.09 
 
 
225 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.43 
 
 
222 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.24 
 
 
187 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.35 
 
 
227 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.92 
 
 
203 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.7 
 
 
219 aa  163  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.14 
 
 
212 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.7 
 
 
219 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.83 
 
 
206 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.19 
 
 
218 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.372545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.39 
 
 
194 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  41.75 
 
 
212 aa  161  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.08 
 
 
195 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.65 
 
 
219 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.16 
 
 
225 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.36 
 
 
225 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1164  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.7 
 
 
188 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.18 
 
 
225 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.31 
 
 
224 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
226 aa  156  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.18 
 
 
245 aa  156  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.65 
 
 
205 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.19 
 
 
205 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.29 
 
 
210 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.47 
 
 
215 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.92 
 
 
223 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.65 
 
 
216 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.48 
 
 
220 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.29 
 
 
229 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.9 
 
 
214 aa  153  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.21 
 
 
195 aa  153  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.29 
 
 
216 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
217 aa  152  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.31 
 
 
206 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
202 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.13 
 
 
222 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.93 
 
 
210 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2533  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.24 
 
 
218 aa  151  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272772  normal  0.391268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0737  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.09 
 
 
213 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.407866  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.44 
 
 
208 aa  149  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.05 
 
 
213 aa  149  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.11 
 
 
190 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.61 
 
 
209 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.5 
 
 
202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.94 
 
 
220 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37 
 
 
313 aa  147  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.47 
 
 
201 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.11 
 
 
222 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2769  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.15 
 
 
227 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.19 
 
 
220 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.43 
 
 
205 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.02 
 
 
210 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.19 
 
 
216 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44 
 
 
221 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.83 
 
 
208 aa  144  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.95 
 
 
203 aa  144  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04480  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.18 
 
 
187 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>