47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3244 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3244  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  373  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0741047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3895  hypothetical protein  99.48 
 
 		 192 aa  371  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4529  hypothetical protein  54.5 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0512  hypothetical protein  40.7 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0590  hypothetical protein  37.8 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  35.68 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  34.2 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0271  LemA protein  34.39 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.497624  hitchhiker  0.00615451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4005  LemA family protein  28.65 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000752628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  29.44 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  31.18 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  29.63 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  24.08 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  25.64 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  28.42 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  28.06 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  27.13 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  29.95 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  27.32 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  25 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  26.06 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  29.59 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  24.12 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  29.08 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  27.08 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  26.34 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  26.49 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  30.22 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  28.92 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  27.47 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  26.42 
 
 		 195 aa  44.7  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  26.78 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  24.26 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  52.94 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  50 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  25.93 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  50 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  25.38 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  24.57 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  30.11 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  24.58 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  26.56 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  25.13 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  26.63 
 
 		 196 aa  42  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  24.47 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  24.73 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5399  LemA family protein  22.53 
 
 		 185 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>