43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2687 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 355 aa  722    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  35.57 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  34.31 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  34.27 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  32.38 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  31.49 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  33.52 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  31.93 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  32.03 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  28.37 
 
 		 358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  28.49 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  26.35 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  23.75 
 
 		 348 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  28.52 
 
 		 323 aa  87  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  34.57 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  29.37 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  26.39 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  40.38 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  37.7 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.67 
 
 		 373 aa  46.6  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3207  ABC transporter related  36.84 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  30.51 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1369  ABC transporter related  25 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141351  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  29.03 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  26.13 
 
 		 559 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  25.69 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  25.81 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  22.22 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  22.54 
 
 		 495 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  35.48 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  32.26 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  20.37 
 
 		 556 aa  43.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  27.92 
 
 		 460 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  27.92 
 
 		 460 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  27.94 
 
 		 364 aa  42.7  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>