40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3137 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3137  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4084  hypothetical protein  71.86 
 
 		 234 aa  321  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4295  hypothetical protein  60.96 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440557  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3507  hypothetical protein  43.75 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2219  hypothetical protein  42.36 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3365  hypothetical protein  41.26 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2077  hypothetical protein  41.7 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3793  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  30.04 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3065  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  32.1 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  33.14 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  31.64 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  31.64 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3297  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.41 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.33 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  32.18 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  33.06 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  31.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  33.64 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  29.87 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  30.64 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  31.64 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  24.87 
 
 		 615 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.13 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  29.87 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  27.69 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  29.63 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.61 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.96 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7865  predicted protein  32.14 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.50782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.25 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  27.27 
 
 		 615 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  32.04 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  31.2 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  27.92 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_003296  RS03178  putative transferase protein  25.63 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442727  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.64 
 
 		 426 aa  42.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.92 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  32 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  26.39 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  30.32 
 
 		 239 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>