165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2650 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  714    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  64.1 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  59.71 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  64.76 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  59.18 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  64.97 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  60.23 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  50.99 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  47.58 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  46.03 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  47.27 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  50.83 
 
 		 356 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  44.72 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  43.8 
 
 		 366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  43.45 
 
 		 366 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  45.2 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  48.19 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  43.09 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  46.48 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  43.79 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  43.91 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  42.43 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  42.12 
 
 		 386 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  41.76 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  41.74 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  40.39 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  43.44 
 
 		 365 aa  233  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  42.01 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  48.25 
 
 		 361 aa  232  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  37.98 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  43.17 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  44.44 
 
 		 351 aa  229  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  36.14 
 
 		 335 aa  228  8e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  50 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  36.02 
 
 		 335 aa  228  2e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  43.44 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  48.31 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  45.38 
 
 		 364 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  49 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  43.39 
 
 		 351 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  43.93 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  35.07 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  42.89 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  42.74 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  34.14 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  30.32 
 
 		 515 aa  186  8e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  37.02 
 
 		 461 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  31.18 
 
 		 504 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  32.96 
 
 		 370 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  31.67 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  31.02 
 
 		 393 aa  122  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  32.79 
 
 		 394 aa  122  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  26.52 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  34.78 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  33.52 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  28.03 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  28.7 
 
 		 387 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  29.67 
 
 		 388 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  29.95 
 
 		 417 aa  112  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  32.77 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  31.82 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  28.06 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  29.72 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  31.32 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  31 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  29.09 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  31.02 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  31.81 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  30.43 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  31.59 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  34.81 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  31.2 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  28.91 
 
 		 386 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  30.75 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  29.52 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  30.54 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  32.51 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.29 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  32.51 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  27.22 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  32.51 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  32.51 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  32.51 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  32.51 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  32.51 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  31.42 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  32.68 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.04 
 
 		 394 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  33.6 
 
 		 391 aa  99.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  28.88 
 
 		 385 aa  99.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  33.33 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  29.89 
 
 		 396 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  32.39 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  30.49 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  32.38 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  30.49 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  33.04 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  32.68 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  32.65 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>