61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2466 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1025    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  46.48 
 
 		 517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  46.86 
 
 		 517 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  45.78 
 
 		 522 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  47.18 
 
 		 500 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  41.54 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  40.47 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  37.96 
 
 		 465 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  38.34 
 
 		 470 aa  316  6e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  39.02 
 
 		 479 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  48.29 
 
 		 700 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  47.15 
 
 		 649 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  52.08 
 
 		 697 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  51.67 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  29.38 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  29.38 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  37.5 
 
 		 585 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  43.09 
 
 		 660 aa  146  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  43.24 
 
 		 724 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  43.16 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  40.54 
 
 		 521 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  40.54 
 
 		 521 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  42.25 
 
 		 569 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  42.86 
 
 		 522 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  42.39 
 
 		 514 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  42.39 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  41.85 
 
 		 509 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  39.27 
 
 		 638 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  40 
 
 		 524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  41.85 
 
 		 518 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  40 
 
 		 521 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  39.36 
 
 		 821 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  40 
 
 		 599 aa  131  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  38.5 
 
 		 551 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  41.08 
 
 		 401 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  40.54 
 
 		 596 aa  127  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  39.67 
 
 		 512 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  38.92 
 
 		 522 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  40.22 
 
 		 544 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  38.95 
 
 		 690 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  41.3 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  36.76 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  34.16 
 
 		 802 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  38.1 
 
 		 781 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  37.44 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  37.77 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  38.42 
 
 		 1117 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  37.77 
 
 		 644 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  34.92 
 
 		 585 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  34.22 
 
 		 542 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  32.07 
 
 		 734 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  37.58 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  34.24 
 
 		 686 aa  85.1  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  29.31 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  28.88 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  28.88 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  29.59 
 
 		 740 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  30.21 
 
 		 740 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  23.47 
 
 		 405 aa  45.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  29.46 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  29.46 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>