52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2321 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  327  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  55.97 
 
 		 176 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  49.68 
 
 		 171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  48.72 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  39.61 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  36.26 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  40.52 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  39.87 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  39.61 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  39.87 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  34.62 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  35.06 
 
 		 178 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  39.33 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  36.36 
 
 		 170 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  34.52 
 
 		 180 aa  94.4  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  35.95 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  38 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  35.95 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  32.68 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  32.14 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  31.08 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  30.3 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  34.15 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  29.45 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  33.12 
 
 		 190 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  33.54 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  28.85 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  28.75 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  28.21 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  25.75 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  31.68 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  30.91 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  30.38 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  28.12 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  31.29 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  31.29 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  27.85 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  28.85 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  34.87 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  28.22 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  22.38 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  28.66 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2406  DinB family protein  28.76 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  24.18 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  26.25 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  24.34 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2344  DNA polymerase, DinB family  24.67 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.724244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2981  DNA polymerase, DinB family  26.8 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.835294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  23.38 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2479  DNA polymerase, DinB family  24.67 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  23.98 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  25.32 
 
 		 175 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>