More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0440 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  100 
 
 
416 aa  851    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  60.1 
 
 
415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  55.88 
 
 
471 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  51.7 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.61 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.22 
 
 
293 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  60.54 
 
 
295 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.17 
 
 
295 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.93 
 
 
303 aa  295  8e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.81 
 
 
308 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  54.94 
 
 
285 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.53 
 
 
288 aa  279  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  54.1 
 
 
285 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  50 
 
 
296 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  49.61 
 
 
272 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  49.25 
 
 
269 aa  267  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  47.7 
 
 
293 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  49.01 
 
 
286 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.47 
 
 
300 aa  266  5e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  48.94 
 
 
301 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  45.55 
 
 
292 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  47.37 
 
 
302 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  50.41 
 
 
278 aa  259  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.71 
 
 
289 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  45.58 
 
 
297 aa  255  9e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.71 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.42 
 
 
289 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.67 
 
 
289 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  51.45 
 
 
284 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  47.69 
 
 
336 aa  250  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  44.17 
 
 
291 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  47.53 
 
 
304 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  43.97 
 
 
297 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.45 
 
 
270 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  47.71 
 
 
265 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  44.06 
 
 
298 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  46.95 
 
 
341 aa  242  9e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  43.07 
 
 
280 aa  242  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  47.71 
 
 
297 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  44.33 
 
 
288 aa  240  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.32 
 
 
287 aa  239  5e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  48.85 
 
 
330 aa  236  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  46.72 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  43.66 
 
 
290 aa  232  9e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  47.74 
 
 
280 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  43.69 
 
 
349 aa  226  6e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  44.53 
 
 
302 aa  226  7e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  47.19 
 
 
281 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  45.32 
 
 
278 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.06 
 
 
269 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.94 
 
 
266 aa  213  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  46.46 
 
 
353 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19821  predicted protein  39.63 
 
 
368 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  43.89 
 
 
291 aa  212  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  46.43 
 
 
336 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  46.15 
 
 
353 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  46.5 
 
 
354 aa  210  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  46.15 
 
 
353 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  45.67 
 
 
356 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.78 
 
 
247 aa  209  9e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.37 
 
 
247 aa  209  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  43.66 
 
 
378 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  42.08 
 
 
370 aa  206  5e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  43.28 
 
 
373 aa  206  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  43.66 
 
 
375 aa  206  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00720  nucleotide binding protein, putative  44.17 
 
 
331 aa  205  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.263635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  43.97 
 
 
277 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  48.47 
 
 
358 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  44.62 
 
 
360 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  43.33 
 
 
351 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  44.19 
 
 
361 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  39.44 
 
 
296 aa  204  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  46.48 
 
 
358 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  41.95 
 
 
305 aa  203  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  46.94 
 
 
345 aa  203  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  46.31 
 
 
368 aa  202  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  45.45 
 
 
304 aa  202  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  43.9 
 
 
358 aa  202  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  43.9 
 
 
358 aa  202  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.29 
 
 
395 aa  202  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1485  hypothetical protein  42.74 
 
 
368 aa  202  7e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450542  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  43.25 
 
 
347 aa  202  8e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  43.23 
 
 
382 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  45.24 
 
 
296 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.73 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  44.94 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  41.25 
 
 
281 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  47.13 
 
 
361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  47.13 
 
 
361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  47.54 
 
 
361 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  47.13 
 
 
361 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0594  chromosome partitioning ATPase protein-like  46.77 
 
 
285 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  43.19 
 
 
357 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  43.23 
 
 
363 aa  199  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11060  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor cfd1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C8Q1]  42.64 
 
 
334 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.725803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  43.03 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  43.35 
 
 
364 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1706  ATPase-like, ParA/MinD  43.09 
 
 
375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0562575  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0411  Mrp protein  45.85 
 
 
358 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>