233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1379 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  100 
 
 		 499 aa  1030    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  60.97 
 
 		 507 aa  634    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  61.65 
 
 		 499 aa  636    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  61.97 
 
 		 499 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  59.56 
 
 		 498 aa  622  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  57.14 
 
 		 500 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  55.13 
 
 		 500 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  49.28 
 
 		 493 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  49.5 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  48.39 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  48 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  47.48 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  47.9 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  48.01 
 
 		 494 aa  448  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  47.28 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  49.29 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  48.47 
 
 		 516 aa  422  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  47.48 
 
 		 496 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  45 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  46.11 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  47.68 
 
 		 522 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  45.83 
 
 		 508 aa  411  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  43.24 
 
 		 487 aa  401  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  41.99 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  41.67 
 
 		 469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  41.67 
 
 		 469 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  41.67 
 
 		 469 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  41.67 
 
 		 469 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  41.22 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  40.99 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  41.55 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  41.59 
 
 		 469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  38.04 
 
 		 547 aa  313  4.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  39.09 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  40.77 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  40.77 
 
 		 469 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  40.54 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  40.68 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  37.42 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  39.11 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  39.32 
 
 		 463 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  40.22 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  40.09 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  39.77 
 
 		 465 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  38.19 
 
 		 580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  41.36 
 
 		 469 aa  304  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  39.95 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  36.85 
 
 		 490 aa  303  5.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  40.68 
 
 		 463 aa  302  8.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  38.3 
 
 		 487 aa  301  1e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  40.18 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  40.68 
 
 		 463 aa  302  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  39.32 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  41.14 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  40.45 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  40.45 
 
 		 461 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  40 
 
 		 468 aa  300  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  40.32 
 
 		 472 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  38.94 
 
 		 487 aa  299  8e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  39.73 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  40.09 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  39.32 
 
 		 463 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  37.04 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  39.41 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  39.78 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  39.32 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  38.65 
 
 		 467 aa  294  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  38.91 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  37.89 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  39.55 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  38.46 
 
 		 511 aa  290  5.0000000000000004e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  38.79 
 
 		 470 aa  289  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  40.36 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  39.5 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  37.72 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  37.72 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  35.7 
 
 		 491 aa  286  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  37.84 
 
 		 473 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  40 
 
 		 458 aa  286  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  37.05 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  38.5 
 
 		 460 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  39.77 
 
 		 458 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  38.32 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  38.41 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  37.92 
 
 		 461 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  36.49 
 
 		 472 aa  280  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  38.2 
 
 		 470 aa  279  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  38.78 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  39.46 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  36.91 
 
 		 473 aa  276  4e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  38.1 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  36.82 
 
 		 463 aa  276  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  37.5 
 
 		 465 aa  276  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  39.51 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  37.95 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  34.57 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  38.78 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  37.81 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  36.09 
 
 		 504 aa  270  5.9999999999999995e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  37.41 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>