More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2810 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2810  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  256  8e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1149  response regulator receiver protein  61.9 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 239 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 376 aa  100  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  44.44 
 
 		 236 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 223 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 223 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2864  two-component response regulator  45.16 
 
 		 383 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384945  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 231 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 234 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 369 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 231 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 223 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  41.27 
 
 		 223 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  41.27 
 
 		 223 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 223 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 223 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 227 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 384 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 229 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 223 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 223 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.84 
 
 		 427 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  41.27 
 
 		 248 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  43.44 
 
 		 230 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  39.68 
 
 		 227 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 223 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  40.48 
 
 		 248 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 243 aa  93.6  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 248 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 231 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 		 229 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 232 aa  93.6  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  36.8 
 
 		 170 aa  93.6  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  40.48 
 
 		 248 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  38.21 
 
 		 231 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 235 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 407 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 393 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1136  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 348 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 230 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 230 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 230 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 204 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 230 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  41.13 
 
 		 235 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  41.13 
 
 		 235 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.75 
 
 		 337 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 235 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  40.16 
 
 		 225 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  40.65 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 235 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  39.68 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  41.13 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  41.13 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  41.13 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  40.5 
 
 		 254 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  41.13 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  41.13 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 503 aa  90.9  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  41.13 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  90.9  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 254 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 241 aa  91.3  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  41.13 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 231 aa  91.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 		 224 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 225 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  90.9  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 225 aa  90.5  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 242 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.32 
 
 		 236 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 228 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 204 aa  90.5  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 229 aa  90.5  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 		 236 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 225 aa  90.1  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  39.34 
 
 		 242 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 247 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 406 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  40.16 
 
 		 225 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  41.6 
 
 		 248 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 243 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 247 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1362 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 243 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 		 255 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 374 aa  90.1  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 223 aa  89.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 230 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 257 aa  89.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 229 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 270 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>