45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2423 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 682 aa  1386    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1800  hypothetical protein  36.36 
 
 		 336 aa  150  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3544  hypothetical protein  32.7 
 
 		 341 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41760  hypothetical protein  31.83 
 
 		 341 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2535  hypothetical protein  30.42 
 
 		 333 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284789  normal  0.0200909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  30.49 
 
 		 421 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3433  hypothetical protein  28.85 
 
 		 438 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3087  hypothetical protein  28.85 
 
 		 438 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2853  hypothetical protein  27.31 
 
 		 426 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.570467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2836  hypothetical protein  27.31 
 
 		 426 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4125  hypothetical protein  25.28 
 
 		 436 aa  90.9  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.891706  hitchhiker  0.000117578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2928  hypothetical protein  26.57 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2093  hypothetical protein  27.14 
 
 		 430 aa  89.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2593  hypothetical protein  29.92 
 
 		 434 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1157  hypothetical protein  26.38 
 
 		 403 aa  87.4  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0338  hypothetical protein  25.72 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  27.48 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0323  hypothetical protein  25.72 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2173  hypothetical protein  25.16 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2962  hypothetical protein  26.42 
 
 		 478 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal  0.70516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0935  hypothetical protein  26.97 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2450  hypothetical protein  29.54 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0447  hypothetical protein  25.67 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  53.85 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1022  hypothetical protein  26.79 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0997867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2318  hypothetical protein  25.33 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1018  hypothetical protein  23.61 
 
 		 348 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  53.66 
 
 		 773 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2587  hypothetical protein  23.47 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2964  hypothetical protein  23.9 
 
 		 243 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0733  hypothetical protein  22.6 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3207  hypothetical protein  24.34 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03498  hypothetical protein  25.4 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  40.22 
 
 		 676 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3460  hypothetical protein  24.19 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1587  hypothetical protein  44.59 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.157291  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5875  hypothetical protein  22.4 
 
 		 490 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5394  hypothetical protein  23.17 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  32 
 
 		 377 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.97 
 
 		 474 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  24.68 
 
 		 235 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3376  Sporulation domain protein  28.09 
 
 		 234 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 424 aa  45.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.66 
 
 		 553 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 532 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>