35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  858    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2593  hypothetical protein  65.22 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  63.64 
 
 		 426 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2836  hypothetical protein  63.64 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2853  hypothetical protein  63.4 
 
 		 426 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.570467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2928  hypothetical protein  63.4 
 
 		 426 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3433  hypothetical protein  39.71 
 
 		 438 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3087  hypothetical protein  39.71 
 
 		 438 aa  279  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2962  hypothetical protein  46.82 
 
 		 478 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal  0.70516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0935  hypothetical protein  46.49 
 
 		 468 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258412  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1022  hypothetical protein  46.82 
 
 		 431 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0997867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4125  hypothetical protein  37.38 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.891706  hitchhiker  0.000117578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2093  hypothetical protein  36.01 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2964  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2173  hypothetical protein  28.38 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2450  hypothetical protein  31.56 
 
 		 329 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0447  hypothetical protein  27.74 
 
 		 446 aa  140  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259604 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03498  hypothetical protein  32.11 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1157  hypothetical protein  25.23 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1018  hypothetical protein  28.71 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3207  hypothetical protein  26.32 
 
 		 429 aa  132  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2318  hypothetical protein  29.84 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3460  hypothetical protein  23.96 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0323  hypothetical protein  26.24 
 
 		 436 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0338  hypothetical protein  26.24 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5394  hypothetical protein  28.09 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5875  hypothetical protein  28.22 
 
 		 490 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0733  hypothetical protein  26.71 
 
 		 367 aa  117  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2587  hypothetical protein  27.27 
 
 		 449 aa  112  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  30.24 
 
 		 682 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0784  hypothetical protein  42.7 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205821  normal  0.0100164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284789  normal  0.0200909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41760  hypothetical protein  26.73 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3544  hypothetical protein  26.73 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1800  hypothetical protein  30.51 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>