35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0447 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0447  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  905    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0338  hypothetical protein  82.37 
 
 		 436 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0323  hypothetical protein  82.59 
 
 		 436 aa  725    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5394  hypothetical protein  54.56 
 
 		 478 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5875  hypothetical protein  68.6 
 
 		 490 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1157  hypothetical protein  48.5 
 
 		 403 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2173  hypothetical protein  39.17 
 
 		 426 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0733  hypothetical protein  44.09 
 
 		 367 aa  272  9e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1018  hypothetical protein  43.15 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3207  hypothetical protein  31.73 
 
 		 429 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2318  hypothetical protein  36.18 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3460  hypothetical protein  40.69 
 
 		 353 aa  237  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03498  hypothetical protein  38.1 
 
 		 331 aa  216  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2587  hypothetical protein  33.02 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0935  hypothetical protein  28.51 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2962  hypothetical protein  27.83 
 
 		 478 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal  0.70516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2450  hypothetical protein  30.86 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3433  hypothetical protein  28.85 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3087  hypothetical protein  28.85 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  27.07 
 
 		 421 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1022  hypothetical protein  29.13 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0997867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  26.16 
 
 		 426 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2928  hypothetical protein  26.38 
 
 		 426 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2836  hypothetical protein  26.85 
 
 		 426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2853  hypothetical protein  26.6 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.570467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2593  hypothetical protein  27.76 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4125  hypothetical protein  26.96 
 
 		 436 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.891706  hitchhiker  0.000117578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2093  hypothetical protein  27.01 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2964  hypothetical protein  28.46 
 
 		 243 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3544  hypothetical protein  24.62 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41760  hypothetical protein  25.18 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  24.44 
 
 		 682 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2535  hypothetical protein  24.62 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284789  normal  0.0200909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1800  hypothetical protein  25.15 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0784  hypothetical protein  26.43 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205821  normal  0.0100164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>