35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5875 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5394  hypothetical protein  76.94 
 
 		 478 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5875  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1004    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0447  hypothetical protein  54.36 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0338  hypothetical protein  54.26 
 
 		 436 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0323  hypothetical protein  54.05 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1157  hypothetical protein  49.4 
 
 		 403 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2173  hypothetical protein  45.58 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1018  hypothetical protein  42.45 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0733  hypothetical protein  40.18 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2318  hypothetical protein  35.73 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3460  hypothetical protein  40.06 
 
 		 353 aa  240  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3207  hypothetical protein  34.74 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03498  hypothetical protein  34.69 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2587  hypothetical protein  33.84 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0935  hypothetical protein  29.48 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2962  hypothetical protein  27.33 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal  0.70516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2450  hypothetical protein  31.02 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1022  hypothetical protein  30.94 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0997867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  28.15 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2928  hypothetical protein  24.6 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3087  hypothetical protein  25.06 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3433  hypothetical protein  24.83 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2593  hypothetical protein  27.38 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  23.31 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2853  hypothetical protein  23.81 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.570467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2836  hypothetical protein  23.81 
 
 		 426 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4125  hypothetical protein  24.93 
 
 		 436 aa  107  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.891706  hitchhiker  0.000117578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2093  hypothetical protein  23.86 
 
 		 430 aa  87  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2964  hypothetical protein  26.07 
 
 		 243 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41760  hypothetical protein  23.9 
 
 		 341 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3544  hypothetical protein  23.58 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  22.15 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1800  hypothetical protein  24.93 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2535  hypothetical protein  22.48 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284789  normal  0.0200909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0784  hypothetical protein  23.23 
 
 		 299 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205821  normal  0.0100164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>