36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4125 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4125  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  900    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.891706  hitchhiker  0.000117578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2964  hypothetical protein  74.9 
 
 		 243 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  36.32 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2836  hypothetical protein  36.65 
 
 		 426 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2853  hypothetical protein  36.41 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.570467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2928  hypothetical protein  36.65 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  37.38 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2593  hypothetical protein  41.55 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3433  hypothetical protein  35.66 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3087  hypothetical protein  35.66 
 
 		 438 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2962  hypothetical protein  37.35 
 
 		 478 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal  0.70516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1022  hypothetical protein  37.04 
 
 		 431 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0997867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0935  hypothetical protein  35.49 
 
 		 468 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2093  hypothetical protein  33.08 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2450  hypothetical protein  34.59 
 
 		 329 aa  154  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1157  hypothetical protein  28.41 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3207  hypothetical protein  26.27 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2318  hypothetical protein  24.88 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0447  hypothetical protein  25.06 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2173  hypothetical protein  25.82 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0338  hypothetical protein  27.95 
 
 		 436 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0323  hypothetical protein  27.95 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3460  hypothetical protein  23.61 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03498  hypothetical protein  25.53 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1018  hypothetical protein  26.67 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0733  hypothetical protein  28.48 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5394  hypothetical protein  27.18 
 
 		 478 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5875  hypothetical protein  23.73 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2587  hypothetical protein  26.28 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0784  hypothetical protein  29.77 
 
 		 299 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205821  normal  0.0100164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  25.28 
 
 		 682 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41760  hypothetical protein  26.85 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3544  hypothetical protein  26.85 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2535  hypothetical protein  22.53 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284789  normal  0.0200909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2965  hypothetical protein  52.46 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1800  hypothetical protein  23.93 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>