35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3087 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3087  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  886    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3433  hypothetical protein  99.54 
 
 		 438 aa  882    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0935  hypothetical protein  48.42 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2962  hypothetical protein  45.24 
 
 		 478 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal  0.70516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1022  hypothetical protein  46.1 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0997867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  38.55 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2593  hypothetical protein  39.45 
 
 		 434 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  38.2 
 
 		 426 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2836  hypothetical protein  40.87 
 
 		 426 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2853  hypothetical protein  41.36 
 
 		 426 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.570467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2928  hypothetical protein  40.62 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4125  hypothetical protein  37.07 
 
 		 436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.891706  hitchhiker  0.000117578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2093  hypothetical protein  38.55 
 
 		 430 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2964  hypothetical protein  38.46 
 
 		 243 aa  172  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0784  hypothetical protein  40.87 
 
 		 299 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205821  normal  0.0100164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1018  hypothetical protein  30.32 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3460  hypothetical protein  31.35 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0447  hypothetical protein  28.92 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2587  hypothetical protein  28.54 
 
 		 449 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2450  hypothetical protein  31.42 
 
 		 329 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0733  hypothetical protein  30.11 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2173  hypothetical protein  24.89 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0323  hypothetical protein  31.63 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0338  hypothetical protein  30.95 
 
 		 436 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1157  hypothetical protein  27.88 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5394  hypothetical protein  25.29 
 
 		 478 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2318  hypothetical protein  24.72 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03498  hypothetical protein  27.18 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5875  hypothetical protein  23.53 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3207  hypothetical protein  24.94 
 
 		 429 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  28.85 
 
 		 682 aa  93.2  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41760  hypothetical protein  27.65 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3544  hypothetical protein  27.65 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2535  hypothetical protein  25.84 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284789  normal  0.0200909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1800  hypothetical protein  25.84 
 
 		 336 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>