24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0784 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0784  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205821  normal  0.0100164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2962  hypothetical protein  71.33 
 
 
478 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal  0.70516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1022  hypothetical protein  77.64 
 
 
431 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0997867  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0935  hypothetical protein  51.89 
 
 
468 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258412  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3087  hypothetical protein  40.08 
 
 
438 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3433  hypothetical protein  39.68 
 
 
438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236996  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4125  hypothetical protein  39.86 
 
 
436 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.891706  hitchhiker  0.000117578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  35.1 
 
 
426 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  42.7 
 
 
421 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2593  hypothetical protein  53.73 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2928  hypothetical protein  50 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692423  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2853  hypothetical protein  52.38 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.570467  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2836  hypothetical protein  52.38 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2093  hypothetical protein  32.67 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2587  hypothetical protein  30.28 
 
 
449 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5394  hypothetical protein  29.81 
 
 
478 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1157  hypothetical protein  38.89 
 
 
403 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2318  hypothetical protein  35.59 
 
 
441 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0733  hypothetical protein  40.74 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2450  hypothetical protein  30.12 
 
 
329 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5875  hypothetical protein  26.44 
 
 
490 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3207  hypothetical protein  35 
 
 
429 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1018  hypothetical protein  35.94 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0447  hypothetical protein  28.17 
 
 
446 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.259604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>