34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2964 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2964  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4125  hypothetical protein  74.9 
 
 		 436 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.891706  hitchhiker  0.000117578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  41.46 
 
 		 426 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2853  hypothetical protein  41.87 
 
 		 426 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.570467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2836  hypothetical protein  41.87 
 
 		 426 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2928  hypothetical protein  42.28 
 
 		 426 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  40 
 
 		 421 aa  187  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2593  hypothetical protein  40.74 
 
 		 434 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3433  hypothetical protein  38.46 
 
 		 438 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3087  hypothetical protein  38.46 
 
 		 438 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2962  hypothetical protein  33.74 
 
 		 478 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal  0.70516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 431 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0997867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0935  hypothetical protein  32.93 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2093  hypothetical protein  35.68 
 
 		 430 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2450  hypothetical protein  33.61 
 
 		 329 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03498  hypothetical protein  30 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1157  hypothetical protein  29.03 
 
 		 403 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0447  hypothetical protein  28.46 
 
 		 446 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2318  hypothetical protein  27.98 
 
 		 441 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0338  hypothetical protein  28.63 
 
 		 436 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0323  hypothetical protein  28.63 
 
 		 436 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1018  hypothetical protein  29.03 
 
 		 348 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0733  hypothetical protein  26.67 
 
 		 367 aa  99.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3460  hypothetical protein  29.66 
 
 		 353 aa  99.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2173  hypothetical protein  26.94 
 
 		 426 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5394  hypothetical protein  28.02 
 
 		 478 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3207  hypothetical protein  26.34 
 
 		 429 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12466  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5875  hypothetical protein  26.07 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  23.9 
 
 		 682 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41760  hypothetical protein  24.88 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3544  hypothetical protein  24.38 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2587  hypothetical protein  24.4 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2535  hypothetical protein  25.5 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284789  normal  0.0200909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1800  hypothetical protein  26.7 
 
 		 336 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>