180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0668 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 
195 aa  400  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  62.57 
 
 
175 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  60.36 
 
 
177 aa  210  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  60.74 
 
 
174 aa  209  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  55.62 
 
 
175 aa  206  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  60.24 
 
 
177 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  54.17 
 
 
173 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  56.63 
 
 
173 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  58.64 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  63.79 
 
 
184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  61.39 
 
 
174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  64.47 
 
 
173 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  58.68 
 
 
168 aa  194  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  57.23 
 
 
190 aa  194  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  53.98 
 
 
174 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  53.3 
 
 
194 aa  193  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  59.01 
 
 
172 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  57.5 
 
 
173 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  62.42 
 
 
188 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  62.42 
 
 
188 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  62.42 
 
 
188 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  62.42 
 
 
177 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  62.42 
 
 
177 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  62.42 
 
 
177 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  59.15 
 
 
171 aa  190  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  53.61 
 
 
174 aa  190  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  54.55 
 
 
174 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  54.55 
 
 
174 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  62.42 
 
 
177 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  57.32 
 
 
174 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  56.25 
 
 
182 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  57.32 
 
 
174 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  54.55 
 
 
174 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  60.78 
 
 
173 aa  188  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  55.68 
 
 
182 aa  187  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  54.29 
 
 
177 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  63.7 
 
 
183 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  55.95 
 
 
176 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  59.63 
 
 
177 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  57.06 
 
 
173 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  55.28 
 
 
173 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  56.6 
 
 
180 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00650  conserved hypothetical protein  54.22 
 
 
252 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110793  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  59.15 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  53.14 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  58.6 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  69.05 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  54.29 
 
 
177 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  53.61 
 
 
186 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  56.63 
 
 
173 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  54.17 
 
 
183 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  56.79 
 
 
193 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  63.5 
 
 
166 aa  178  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  53.12 
 
 
176 aa  176  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  52.53 
 
 
177 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  61.04 
 
 
169 aa  175  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  49.71 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39320  Appr-1-p processing protein  56.02 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  54.27 
 
 
171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  47.95 
 
 
179 aa  171  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  55 
 
 
181 aa  170  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  52.1 
 
 
181 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  48.37 
 
 
374 aa  169  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  55.7 
 
 
163 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  51.83 
 
 
170 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  53.66 
 
 
180 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  53.09 
 
 
181 aa  168  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  49.4 
 
 
167 aa  167  8e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  53.85 
 
 
177 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  52.91 
 
 
179 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  52.91 
 
 
179 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  54.55 
 
 
171 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  52.76 
 
 
171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  52.33 
 
 
179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  52.33 
 
 
179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  53.61 
 
 
173 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  48.3 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  52.33 
 
 
179 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  46.71 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  49.42 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  50.3 
 
 
176 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  50.59 
 
 
177 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  50.59 
 
 
177 aa  158  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  50.59 
 
 
177 aa  158  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  49.7 
 
 
186 aa  158  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  50.59 
 
 
177 aa  158  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  50.59 
 
 
177 aa  158  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  50.59 
 
 
177 aa  158  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  50.59 
 
 
177 aa  158  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  50.59 
 
 
177 aa  158  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  50.6 
 
 
180 aa  158  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  50 
 
 
197 aa  157  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  49.09 
 
 
174 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  47.65 
 
 
179 aa  154  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  51.22 
 
 
173 aa  154  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  48.52 
 
 
172 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0422  appr-1-p processing domain-containing protein  47.34 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0191366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  50 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  53.69 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>