More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0209 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
258 aa  503  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  43.72 
 
 
266 aa  178  7e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  43.26 
 
 
266 aa  174  9e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  43.26 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  42.93 
 
 
266 aa  169  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  40.29 
 
 
265 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  35.27 
 
 
270 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  38.97 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  36.45 
 
 
263 aa  148  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3448  NifC-like ABC-type porter  37.69 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  36.8 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  38.32 
 
 
288 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
274 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227965  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  40.09 
 
 
273 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1583  NifC-like ABC-type porter  37.1 
 
 
257 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.583953  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.23 
 
 
223 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
293 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1820  NifC-like ABC-type porter  33.47 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0980695  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2207  NifC-like ABC-type porter  34.8 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1306  molybdate ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  36.7 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.84 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1021  NifC-like ABC-type porter  35.91 
 
 
260 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 
225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0923  NifC-like ABC-type porter  36.67 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.65 
 
 
262 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  35.45 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  35.85 
 
 
271 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  35.64 
 
 
232 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.61 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.89 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  31.58 
 
 
287 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  34.6 
 
 
270 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.36 
 
 
259 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  36.63 
 
 
228 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2783  ABC-type transport systems, permease component  32.53 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000474953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  36.82 
 
 
229 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.11 
 
 
271 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 
226 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.94 
 
 
221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  35.32 
 
 
230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  38.32 
 
 
263 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  37.62 
 
 
238 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  34.43 
 
 
229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  35.61 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.412786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  35.61 
 
 
228 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  36.7 
 
 
236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4088  polysaccharide export protein  32.24 
 
 
279 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
222 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  36.63 
 
 
238 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  31.91 
 
 
279 aa  111  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.99 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.09 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  34.11 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  35.64 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  39.41 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  35.64 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3756  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  32.24 
 
 
277 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.82 
 
 
224 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  33.49 
 
 
222 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.05 
 
 
221 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.81 
 
 
229 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1226  NifC-like ABC-type porter  38.59 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000058663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  34.85 
 
 
338 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.41 
 
 
229 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.09 
 
 
221 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  33.64 
 
 
267 aa  108  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  35.64 
 
 
231 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2345  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.23 
 
 
223 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  37.16 
 
 
231 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
269 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.82 
 
 
233 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  36.08 
 
 
228 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2303  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.23 
 
 
223 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1860  molybdenum ABC transporter, permease protein ModB  31.63 
 
 
223 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  34 
 
 
233 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.78 
 
 
228 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.78 
 
 
228 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
288 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  36.61 
 
 
228 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  36.98 
 
 
245 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  36.61 
 
 
228 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
230 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
628 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3860  sulfate/molybdate ABC transporter inner membrane protein  30.84 
 
 
277 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.384915  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4180  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.84 
 
 
277 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456448  normal  0.122933 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.28 
 
 
221 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 
274 aa  105  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  35.94 
 
 
239 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.33 
 
 
288 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.61 
 
 
227 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.26 
 
 
285 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>