More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1277 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  93.92 
 
 		 576 aa  1087    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  100 
 
 		 576 aa  1142    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  94.44 
 
 		 576 aa  1092    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  53.48 
 
 		 610 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  51.4 
 
 		 607 aa  599  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  51.73 
 
 		 571 aa  579  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.49 
 
 		 571 aa  559  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0529  small GTP-binding protein  50.09 
 
 		 587 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  46.45 
 
 		 572 aa  518  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  38.16 
 
 		 650 aa  393  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  33.88 
 
 		 606 aa  346  5e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  34.24 
 
 		 616 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  34.2 
 
 		 620 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  33.7 
 
 		 658 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  31.66 
 
 		 607 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  33.17 
 
 		 663 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  33.49 
 
 		 623 aa  292  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 634 aa  292  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  30.96 
 
 		 661 aa  289  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  31.74 
 
 		 688 aa  289  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.58 
 
 		 614 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  31.91 
 
 		 662 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  31.63 
 
 		 688 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  33.12 
 
 		 650 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  34.05 
 
 		 637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  30.91 
 
 		 657 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  33.23 
 
 		 616 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  31.8 
 
 		 619 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  31.16 
 
 		 663 aa  280  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  31.03 
 
 		 607 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  31.38 
 
 		 659 aa  273  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  30.59 
 
 		 663 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  30.43 
 
 		 689 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  31.2 
 
 		 624 aa  268  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  30.21 
 
 		 663 aa  266  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  31.29 
 
 		 662 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.49 
 
 		 688 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  28.45 
 
 		 587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  29.82 
 
 		 631 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  28.9 
 
 		 587 aa  216  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  28.87 
 
 		 770 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  32.77 
 
 		 676 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  28.55 
 
 		 770 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  29.28 
 
 		 668 aa  210  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  29.51 
 
 		 774 aa  209  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  28.75 
 
 		 646 aa  207  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  29.39 
 
 		 666 aa  206  9e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  28.14 
 
 		 647 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2517  ferrous iron transport protein B  28.43 
 
 		 764 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.487661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.08 
 
 		 649 aa  204  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  28.14 
 
 		 647 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  29.69 
 
 		 631 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  27.73 
 
 		 665 aa  202  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3122  ferrous iron transport protein B  28.41 
 
 		 764 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440223 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  27.94 
 
 		 647 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  29.15 
 
 		 778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  39.46 
 
 		 657 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  33.76 
 
 		 487 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  27.74 
 
 		 688 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2616  ferrous iron transport protein B  29.33 
 
 		 770 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  32.05 
 
 		 664 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  28.73 
 
 		 691 aa  197  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  30.62 
 
 		 717 aa  197  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  28.48 
 
 		 662 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  28.08 
 
 		 753 aa  194  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  28.54 
 
 		 597 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  28.26 
 
 		 764 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  29.34 
 
 		 764 aa  193  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  29.87 
 
 		 786 aa  193  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  29.52 
 
 		 664 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1532  ferrous iron transport protein B  27.07 
 
 		 764 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  27.09 
 
 		 606 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  30.34 
 
 		 715 aa  188  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  28.96 
 
 		 778 aa  187  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  31.95 
 
 		 654 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  26.13 
 
 		 669 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  28.62 
 
 		 595 aa  185  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  28.85 
 
 		 743 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  26.44 
 
 		 716 aa  183  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  26.56 
 
 		 669 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  31.79 
 
 		 663 aa  183  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  26.12 
 
 		 680 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  27.53 
 
 		 786 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  29.06 
 
 		 704 aa  182  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  30.66 
 
 		 693 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  30.04 
 
 		 712 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  26.76 
 
 		 664 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  26.76 
 
 		 664 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  29.19 
 
 		 720 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  31.79 
 
 		 665 aa  180  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  28.3 
 
 		 664 aa  179  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  30.88 
 
 		 665 aa  178  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1597  GTP-binding protein HSR1-related  27.95 
 
 		 617 aa  179  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01364  hypothetical protein  28.01 
 
 		 758 aa  178  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  30.1 
 
 		 772 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  32.6 
 
 		 618 aa  177  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  27.96 
 
 		 769 aa  177  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1215  ferrous iron transport protein B  29.04 
 
 		 764 aa  176  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  30.1 
 
 		 772 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  30.1 
 
 		 772 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>