24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3589 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  51.41 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  34.93 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  40.74 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  39.26 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  38.1 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  38.35 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  32.19 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  32.82 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  30.41 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  27.05 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  30.47 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2468  hypothetical protein  29.91 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0371794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  41.38 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  25.58 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  25.93 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  21.37 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  32.99 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  29.17 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>