183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3539 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
298 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  59.25 
 
 
294 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  59.59 
 
 
294 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  54.79 
 
 
300 aa  336  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  37.67 
 
 
298 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  37.58 
 
 
306 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  39.52 
 
 
301 aa  208  1e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  35.4 
 
 
288 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  37.65 
 
 
1264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  36.8 
 
 
1053 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  38.49 
 
 
1064 aa  162  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  33.96 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  27.84 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  32.16 
 
 
286 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  33.09 
 
 
283 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  31.39 
 
 
259 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  32.71 
 
 
283 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  31.85 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  30.31 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  36.16 
 
 
286 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  32.08 
 
 
284 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  32.12 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  31.68 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  30.65 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  29.76 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  32.31 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  32.07 
 
 
280 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  31.95 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6208  putative phosphatidylserine decarboxylase  29.66 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000986716  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  30.68 
 
 
289 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  30.92 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  30.92 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  30.92 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  30.92 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  30.92 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  29.67 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  30.18 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  31.05 
 
 
297 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  30.92 
 
 
262 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  30.92 
 
 
262 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  27.53 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  30.18 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  30.92 
 
 
262 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  31.1 
 
 
306 aa  109  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  33.03 
 
 
289 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  31.23 
 
 
254 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  26.52 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  30.47 
 
 
282 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
283 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 
322 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 
322 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 
322 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 
293 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 
322 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  28.45 
 
 
259 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4622  phosphatidylserine decarboxylase  30.61 
 
 
292 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  28.46 
 
 
342 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  30.33 
 
 
294 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  31.47 
 
 
285 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  30.6 
 
 
322 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  30.6 
 
 
322 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  30.6 
 
 
322 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  30.15 
 
 
264 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  30.6 
 
 
322 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  30.6 
 
 
322 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  30.6 
 
 
322 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  30.6 
 
 
322 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  29.89 
 
 
322 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  31.4 
 
 
289 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  27.7 
 
 
282 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  32.73 
 
 
288 aa  105  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  30.22 
 
 
322 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  30.22 
 
 
322 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  31.39 
 
 
292 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  29.37 
 
 
287 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  28.85 
 
 
284 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0699  phosphatidylserine decarboxylase  31.62 
 
 
297 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  27.34 
 
 
282 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  30.2 
 
 
302 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  28.76 
 
 
293 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  30.74 
 
 
292 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  31.1 
 
 
285 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  30.74 
 
 
292 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  28.52 
 
 
286 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  31.88 
 
 
285 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  31.1 
 
 
289 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  28.39 
 
 
277 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  30.3 
 
 
287 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  30.15 
 
 
261 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  28.3 
 
 
293 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  28.3 
 
 
293 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  29.5 
 
 
345 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  28.3 
 
 
293 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  31.12 
 
 
285 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3604  phosphatidylserine decarboxylase  30.49 
 
 
290 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247299 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  28.76 
 
 
293 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  30.23 
 
 
294 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  30.99 
 
 
292 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  31.35 
 
 
288 aa  102  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>