232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3053 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  100 
 
 		 494 aa  1022    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  49.8 
 
 		 499 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  51.16 
 
 		 500 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  50.41 
 
 		 507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  50.21 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  48 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  50.84 
 
 		 499 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  47.69 
 
 		 498 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000457965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  45.05 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000229411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  46.76 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  45.34 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  45.34 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  46.32 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000123828  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  44.72 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  43.74 
 
 		 497 aa  403  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  44.3 
 
 		 487 aa  395  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  45.81 
 
 		 522 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  43.03 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  44.84 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  42.42 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000688351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  42.97 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  0.000000294032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  43.27 
 
 		 496 aa  366  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  40.81 
 
 		 502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  40.28 
 
 		 504 aa  350  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  37.42 
 
 		 504 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  40.09 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  37.28 
 
 		 498 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  38.39 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  38.75 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  39.14 
 
 		 465 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  39 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  39 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  39.96 
 
 		 471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  39.01 
 
 		 469 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  40.37 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  38.53 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  38.64 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  38.95 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  35.79 
 
 		 476 aa  280  3e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  39.03 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  38.41 
 
 		 469 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  38.1 
 
 		 468 aa  280  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  39.2 
 
 		 474 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  37.71 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  38.39 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  37.86 
 
 		 469 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  37.67 
 
 		 473 aa  276  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  36.2 
 
 		 460 aa  276  7e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  37.92 
 
 		 463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  36.73 
 
 		 461 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  37.64 
 
 		 469 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  37.14 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  37.64 
 
 		 469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  37.01 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  34.83 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  37.64 
 
 		 469 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  38.65 
 
 		 465 aa  273  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  36.25 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  35.97 
 
 		 460 aa  269  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  36.59 
 
 		 470 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  35.96 
 
 		 480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  36.2 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  36.36 
 
 		 470 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  36.53 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  35.64 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  36.61 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  36.12 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  36.14 
 
 		 472 aa  264  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  36.47 
 
 		 472 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  38.13 
 
 		 460 aa  262  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  34.65 
 
 		 547 aa  262  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  36.73 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  35.99 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  35.86 
 
 		 470 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  37.95 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  37.68 
 
 		 435 aa  262  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  35.03 
 
 		 480 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  36.36 
 
 		 476 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  36.16 
 
 		 472 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  36.44 
 
 		 475 aa  261  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  36.36 
 
 		 476 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  35.78 
 
 		 471 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  35.36 
 
 		 470 aa  259  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  35.76 
 
 		 461 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  33.54 
 
 		 487 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  36.76 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  35.78 
 
 		 472 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  36.89 
 
 		 475 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  36.38 
 
 		 461 aa  257  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  36.67 
 
 		 461 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  36.16 
 
 		 472 aa  256  8e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  36.99 
 
 		 461 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  36.91 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  35.57 
 
 		 487 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  35.84 
 
 		 465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  35.94 
 
 		 471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  35.4 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0902  threonine synthase  34.52 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0582732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  35.78 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  35.96 
 
 		 481 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>