More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1837 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  100 
 
 		 110 aa  229  8.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  60 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  60.19 
 
 		 110 aa  140  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  56.73 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  56.73 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  55.77 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  127  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  57.14 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  53.85 
 
 		 104 aa  124  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  54.55 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  54.46 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  54.08 
 
 		 103 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  54.37 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  54.55 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  51.49 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  51.49 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  52.48 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  51.49 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  53.33 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  51.46 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50.5 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  50.5 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  56.99 
 
 		 105 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  119  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  56 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  54.37 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  54.46 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  55.88 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  55.56 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  53.4 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  54.55 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  56.52 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  49.06 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  49.51 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  49.51 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  50 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  51.49 
 
 		 109 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  49.51 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  48.11 
 
 		 109 aa  116  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  50.98 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  51.61 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  46.6 
 
 		 223 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  50.53 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  52 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  47.62 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  50.98 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  54.74 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  49.51 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  47.62 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  53.4 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  48.11 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  47.66 
 
 		 108 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  51.46 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  49.51 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  48.54 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  47.57 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  47.62 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  53.4 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  47.57 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  47.57 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  50.49 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  46.08 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  52.63 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  49.04 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  46.23 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  50 
 
 		 238 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  48 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  43.52 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  52.48 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>