56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1780 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  49.02 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  45.24 
 
 		 204 aa  151  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  43.27 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  40.29 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  36.92 
 
 		 246 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  44.93 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  43.48 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  42.22 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  43.18 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  41.06 
 
 		 239 aa  131  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  41.07 
 
 		 238 aa  130  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  43.75 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  43.75 
 
 		 230 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  39.81 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  49.42 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  39.21 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  44.09 
 
 		 264 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  44.55 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  44.55 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  44.55 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  44.09 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  44.55 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  43.11 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  44.55 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  43.11 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  41.1 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  43.11 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  42.41 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  39.56 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  39.61 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  42.86 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  41.55 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  38.74 
 
 		 250 aa  111  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  42.7 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  40.62 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  47.16 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  46.02 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  46.67 
 
 		 167 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  34.42 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  36.67 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  40.32 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  41.27 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  24.57 
 
 		 512 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  42.42 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  26.83 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  38.33 
 
 		 260 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  41.18 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  42.25 
 
 		 274 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1359  hypothetical protein  28.65 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000393544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  30.67 
 
 		 249 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  33.94 
 
 		 311 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  35.59 
 
 		 266 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  38.37 
 
 		 262 aa  41.6  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1316  hypothetical protein  35.34 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>