More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4962 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  100 
 
 		 408 aa  837    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  72.21 
 
 		 403 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  57.33 
 
 		 382 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  50.26 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  49.62 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  47.55 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.77 
 
 		 399 aa  364  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  44.17 
 
 		 406 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1939  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  44.22 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  45.16 
 
 		 406 aa  295  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  45.43 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  44.92 
 
 		 406 aa  292  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  42.78 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  43.55 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  42.52 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  43.55 
 
 		 377 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  38.71 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  37.37 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  38.59 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  37.3 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  36.83 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  36.83 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  37.3 
 
 		 377 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  36.56 
 
 		 377 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  36.56 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  36.56 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  36.56 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  36.56 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  36.56 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  38.24 
 
 		 372 aa  259  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  36.56 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  37.77 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  36.77 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  37.77 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  36.77 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  36.02 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  36.56 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  39.25 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  36.77 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  36.77 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  36.77 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  36.77 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  36.77 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  36.77 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  36.9 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  37.63 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  36.51 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  38.9 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  37.37 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  37.1 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  37.1 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  37.47 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  39.01 
 
 		 373 aa  250  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  37.87 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  37.77 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  36.83 
 
 		 371 aa  249  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  34.58 
 
 		 371 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  36.07 
 
 		 390 aa  249  8e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  37.1 
 
 		 371 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  37.64 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  36.83 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  36.83 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  37.98 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  37.53 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  37.29 
 
 		 372 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  34.58 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  34.58 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  34.58 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  37.2 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  34.95 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  37.9 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  37 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  36.36 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  35.85 
 
 		 371 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  36.31 
 
 		 369 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  36.02 
 
 		 371 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  36.04 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  38.77 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  34.95 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  37.47 
 
 		 371 aa  242  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  35.92 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  34.68 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  35.54 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  35.97 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  35.92 
 
 		 373 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  37.29 
 
 		 363 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  38.23 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  33.78 
 
 		 371 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  36.83 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  36.83 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  37.19 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  36.73 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  35.31 
 
 		 370 aa  236  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  35.12 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  37.87 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  36.73 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  34.86 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  37.37 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  35.68 
 
 		 371 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>