24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2529 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  931    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  40.56 
 
 		 650 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  48.43 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  42.07 
 
 		 323 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3345  hypothetical protein  37.03 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2351  hypothetical protein  34.42 
 
 		 296 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.428025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  36.64 
 
 		 1101 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2350  hypothetical protein  32.69 
 
 		 295 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0668195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  39.32 
 
 		 1168 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  34.81 
 
 		 1026 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  36.7 
 
 		 953 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3469  Hep_Hag  41.77 
 
 		 777 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259932  normal  0.0166964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  35.11 
 
 		 781 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  29.55 
 
 		 918 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3420  hypothetical protein  34.51 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3468  Hep_Hag  40.26 
 
 		 843 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186324  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  27.31 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  33.01 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  35.92 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5246  Carbohydrate-binding family V/XII  29.81 
 
 		 562 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  hitchhiker  0.0000498819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2216  hypothetical protein  46.43 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3030  hypothetical protein  42.59 
 
 		 59 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.644466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1037 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2909  hypothetical protein  24.07 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>