294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0759 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0759  putative cytochrome c  100 
 
 
296 aa  617  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2958  cytochrome c family protein  29.96 
 
 
327 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184692  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0728  cytochrome c-related protein  29.39 
 
 
321 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264132  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.9 
 
 
498 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2867  cytochrome c-related protein  27.16 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2430  cytochrome c, class I  27.56 
 
 
301 aa  89.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  28.37 
 
 
425 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  26.49 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.64 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  26.49 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.49 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.01 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0080  cytochrome c-related protein  28.09 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.670842  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.85 
 
 
426 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.77 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  27.91 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.5 
 
 
434 aa  82.8  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  28.25 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  29.06 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  29.06 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  29.03 
 
 
432 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.03 
 
 
432 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  29.03 
 
 
432 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  30.8 
 
 
434 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  30.8 
 
 
434 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.18 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.07 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0306  class I diheme cytochrome c  27.31 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  26.33 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  28.46 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.68 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  31.18 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  26.33 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.5 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0648  cytochrome c family protein  24.69 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.46 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1951  class I diheme cytochrome c  26.92 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5275  cytochrome c-related protein  30.8 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  28.68 
 
 
497 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  29.49 
 
 
432 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  27.71 
 
 
439 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.48 
 
 
461 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.03 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  30.53 
 
 
554 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.14 
 
 
415 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.12 
 
 
1187 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  29.09 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  28.71 
 
 
1187 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  29.09 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  28.3 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.77 
 
 
530 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  29.34 
 
 
1187 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.38 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  28.79 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  29.09 
 
 
650 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.21 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  28.79 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  28.79 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  28.3 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  28.79 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.95 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3802  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.44 
 
 
455 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.503165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  28.1 
 
 
450 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2272  cytochrome c, class I  30.6 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242682  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.5 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  30.38 
 
 
1187 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  27.38 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1162  cytochrome c  27.8 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.460761  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  27.27 
 
 
430 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  29.89 
 
 
527 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  29.89 
 
 
527 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  28.15 
 
 
439 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  26.52 
 
 
429 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.32 
 
 
426 aa  75.5  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  27.95 
 
 
430 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.91 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  29.56 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.6 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.74 
 
 
527 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.8 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.07 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1781  cytochrome c, class I  28.4 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.11 
 
 
1191 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1130  putative cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  29.46 
 
 
484 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.84 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.1 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.12 
 
 
1179 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.67 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  27.94 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  27.94 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  27 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  30.35 
 
 
421 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  29.09 
 
 
463 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  27.97 
 
 
434 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1417  cytochrome c, class I  26.28 
 
 
421 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00268752  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2148  hypothetical protein  31.95 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.61368  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1104  cytochrome c, class I  28.52 
 
 
416 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.78 
 
 
415 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  26.82 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.31 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>