31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0545 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  81.7 
 
 
408 aa  663    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  84.8 
 
 
408 aa  685    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  832    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  30.32 
 
 
437 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  23.05 
 
 
286 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3748  hypothetical protein  27.93 
 
 
1012 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.440981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.21 
 
 
1078 aa  60.1  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  22.9 
 
 
982 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
421 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  26.25 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.94 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  28.12 
 
 
474 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  26.72 
 
 
456 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0685  hypothetical protein  26.8 
 
 
460 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  26.94 
 
 
471 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  23.86 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  25.83 
 
 
544 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3686  hypothetical protein  24.55 
 
 
1041 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3755  hypothetical protein  24.55 
 
 
1041 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3616  hypothetical protein  24.55 
 
 
1041 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  28.1 
 
 
268 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3662  hypothetical protein  30.58 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
468 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2418  hypothetical protein  22.63 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  27.87 
 
 
304 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  23.32 
 
 
633 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4197  hypothetical protein  28.48 
 
 
749 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124038  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1976  hypothetical protein  27.34 
 
 
471 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0040  hypothetical protein  25 
 
 
448 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.217581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>