58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1064 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  100 
 
 		 604 aa  1225    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  51.34 
 
 		 590 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  49.27 
 
 		 585 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  47.21 
 
 		 573 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  40.24 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  38.89 
 
 		 635 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  28.62 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  28.78 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  26.7 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  28.7 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  27.76 
 
 		 727 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  26.07 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  30.04 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  23.03 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  25.86 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  26.98 
 
 		 406 aa  62  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.43 
 
 		 749 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  25.43 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  25.72 
 
 		 584 aa  60.1  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  23.35 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  23.5 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  24.85 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  24.86 
 
 		 762 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  27.6 
 
 		 745 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  26.27 
 
 		 766 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  26.01 
 
 		 763 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  26.01 
 
 		 763 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  29.68 
 
 		 757 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  28.41 
 
 		 769 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.01 
 
 		 716 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  26.01 
 
 		 763 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  28.41 
 
 		 844 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  29.07 
 
 		 397 aa  55.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  28.29 
 
 		 391 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  31.78 
 
 		 443 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  29.38 
 
 		 745 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  29.38 
 
 		 745 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.47 
 
 		 756 aa  54.3  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  28.64 
 
 		 389 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  23.66 
 
 		 752 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  33.78 
 
 		 669 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  29.76 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  27.03 
 
 		 410 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.75 
 
 		 745 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  24.57 
 
 		 752 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  23.83 
 
 		 426 aa  50.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  30.9 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  27.06 
 
 		 420 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  27.75 
 
 		 745 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  30.07 
 
 		 438 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  34.25 
 
 		 486 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  25.43 
 
 		 582 aa  48.5  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.65 
 
 		 420 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  23.74 
 
 		 750 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  30.5 
 
 		 628 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  21.33 
 
 		 575 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  30.57 
 
 		 647 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>