More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0760 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0760  cytidylate kinase  100 
 
 		 230 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0909  cytidylate kinase  63.3 
 
 		 219 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  62.61 
 
 		 232 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  56.07 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  53.46 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  46.61 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  49.27 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.04 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  43.84 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  37.99 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  37.99 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  43.36 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  39.64 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  43.3 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  42.58 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  42.22 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  40 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1024  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000194676  unclonable  0.0000000000298139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0902  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.210574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  44.76 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 227 aa  158  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  39.19 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  39.53 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000021992  hitchhiker  0.0000000124191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  40 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  38.68 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40 
 
 		 511 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1588  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000460348  hitchhiker  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40 
 
 		 511 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  38.03 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.79 
 
 		 516 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1541  cytidylate kinase  39.01 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1598  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  41.71 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.79 
 
 		 516 aa  151  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1674  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  37.04 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  39.44 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.64 
 
 		 517 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>