More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1539 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  100 
 
 
245 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  64.41 
 
 
244 aa  294  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  62.39 
 
 
244 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  43.62 
 
 
248 aa  201  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  33.19 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  31.2 
 
 
256 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  30.74 
 
 
275 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  30.8 
 
 
259 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  31.62 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  32.88 
 
 
269 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  29.34 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  30.08 
 
 
279 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  29.34 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 
266 aa  118  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  29.49 
 
 
245 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  28.85 
 
 
267 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  30.47 
 
 
257 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  27.16 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  27.16 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  32.14 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  28.97 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  27.27 
 
 
261 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  27.57 
 
 
262 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  27.16 
 
 
262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  30.33 
 
 
288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  27.12 
 
 
249 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  27.16 
 
 
262 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  30.24 
 
 
265 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  26.36 
 
 
261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  28.29 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  29.3 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  30.6 
 
 
263 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  29.6 
 
 
296 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  29.57 
 
 
257 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  28.63 
 
 
257 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  27.95 
 
 
271 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  27.69 
 
 
295 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  27.5 
 
 
295 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  30.04 
 
 
259 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.13 
 
 
259 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  29.53 
 
 
290 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  30.93 
 
 
246 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  26.14 
 
 
253 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 
259 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  25.45 
 
 
338 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  25.1 
 
 
280 aa  101  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  26.01 
 
 
286 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1807  OmpA/MotB  28.33 
 
 
229 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.423379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  25.77 
 
 
271 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  27.71 
 
 
251 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  32.94 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  27.8 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  26.8 
 
 
296 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  23.79 
 
 
271 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  26.12 
 
 
285 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  26.53 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  25.51 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  30.46 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  31.36 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  28.11 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1171  MotB-like flagellar protein  33.64 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  26.38 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  26.09 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  24.71 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  29 
 
 
273 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  28.57 
 
 
281 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  25.71 
 
 
285 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  28.57 
 
 
273 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  28.37 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1169  OmpA/MotB domain protein  28.1 
 
 
266 aa  95.1  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00345179  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  31.7 
 
 
219 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  28.86 
 
 
236 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  27.44 
 
 
295 aa  95.1  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  28 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  29.33 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  29.24 
 
 
272 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  27.95 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  29.96 
 
 
296 aa  92  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  27.07 
 
 
241 aa  92  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  26.77 
 
 
342 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  29.13 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  38.89 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2320  OmpA/MotB domain-containing protein  33.05 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000584823  hitchhiker  0.000182851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  31.76 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.75 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  23.6 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  34.38 
 
 
366 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 
280 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 
366 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  25.93 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  30.11 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1270  OmpA/MotB  30.13 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.752029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  25.65 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  31.47 
 
 
215 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>