49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0897 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  100 
 
 		 139 aa  283  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  73.72 
 
 		 140 aa  214  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  72.99 
 
 		 140 aa  213  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  45.52 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  44.78 
 
 		 144 aa  106  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  38.17 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  36.22 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  36.15 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  39.39 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  40 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  36.43 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  38.21 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  35.11 
 
 		 133 aa  84.3  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  36.15 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  32.79 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  40.43 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  37.93 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  32.48 
 
 		 500 aa  64.7  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  33.71 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  27.64 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  26.98 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  32.77 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  37.5 
 
 		 506 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  34.09 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  32.22 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  31.03 
 
 		 545 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 		 568 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1580  hypothetical protein  39.06 
 
 		 303 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3857  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.021633  normal  0.0299401 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4308  hypothetical protein  38.33 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  26.92 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  28.41 
 
 		 549 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4527  putative phage-related protein  46.94 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  27.82 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1120  hypothetical protein  34.44 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  22.52 
 
 		 550 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0749  hypothetical protein  36.05 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1215  hypothetical protein  36.05 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481243  hitchhiker  0.000377554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1042  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  28.41 
 
 		 532 aa  42.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0939  hypothetical protein  36.05 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1211  hypothetical protein  35.35 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634004  hitchhiker  0.00000168855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0760  hypothetical protein  29.91 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0893  hypothetical protein  32.22 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0880  hypothetical protein  33.72 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  30.49 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>