More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2757 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  86.31 
 
 
263 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  81.82 
 
 
266 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  81.99 
 
 
266 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  79.84 
 
 
262 aa  417  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  77.39 
 
 
262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  77.01 
 
 
262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  77.39 
 
 
262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  67.44 
 
 
258 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  67.83 
 
 
257 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  67.83 
 
 
258 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  67.44 
 
 
259 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  67.83 
 
 
258 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  67.44 
 
 
258 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  53.26 
 
 
261 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  53.76 
 
 
276 aa  245  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  48.84 
 
 
253 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  47.49 
 
 
273 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  42.25 
 
 
260 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  43.72 
 
 
263 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  39.84 
 
 
261 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  44.14 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  45.27 
 
 
258 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  35.18 
 
 
250 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  38.49 
 
 
251 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  35.29 
 
 
253 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  34.66 
 
 
250 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  37.45 
 
 
249 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  34.14 
 
 
265 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.83 
 
 
274 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.55 
 
 
258 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  39.15 
 
 
269 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  36.05 
 
 
279 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  34.91 
 
 
258 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  33.33 
 
 
255 aa  155  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  32.4 
 
 
262 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.74 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.98 
 
 
250 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  38.72 
 
 
265 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  37.96 
 
 
264 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  37.86 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
255 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
250 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  39.16 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  31.51 
 
 
275 aa  145  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  35.2 
 
 
255 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  32.23 
 
 
254 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 
267 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  35.5 
 
 
268 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  34.3 
 
 
258 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.44 
 
 
268 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  35.12 
 
 
266 aa  142  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 
271 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  37.85 
 
 
255 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  33.2 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  36.14 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  35.74 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  33.2 
 
 
250 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  35.06 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  36.11 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.5 
 
 
271 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  36.32 
 
 
263 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  32 
 
 
258 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  32.51 
 
 
261 aa  139  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  35.19 
 
 
255 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  31.85 
 
 
271 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  31.85 
 
 
271 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.85 
 
 
271 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.85 
 
 
271 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.85 
 
 
271 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  31.85 
 
 
271 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  35.19 
 
 
281 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.85 
 
 
271 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.87 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.51 
 
 
625 aa  138  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  36.73 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  32.22 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  35.8 
 
 
277 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  36.92 
 
 
255 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2191  ABC transporter related  37.8 
 
 
313 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  37.3 
 
 
284 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  37.05 
 
 
282 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  33.87 
 
 
269 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  36.33 
 
 
273 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  34.63 
 
 
250 aa  137  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  36.79 
 
 
253 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
265 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 
270 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.93 
 
 
270 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  36.86 
 
 
250 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.93 
 
 
270 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  36.79 
 
 
253 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
293 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  35.43 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1710  ABC transporter related  32.31 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  37.45 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>