69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2193 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2193  NUDIX hydrolase  100 
 
 
168 aa  350  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2293  NUDIX hydrolase  77.98 
 
 
162 aa  263  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  34.92 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  34.78 
 
 
383 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
142 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.23 
 
 
384 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
282 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.16 
 
 
345 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.16 
 
 
345 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  31.82 
 
 
363 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  36.9 
 
 
141 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  36.23 
 
 
384 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  34.52 
 
 
142 aa  44.3  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  37.31 
 
 
314 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  33.71 
 
 
473 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  40 
 
 
130 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  40 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  27.87 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
128 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10096  NUDIX domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11490)  29.36 
 
 
237 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.34 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
377 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.55 
 
 
351 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3018  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
208 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391362  normal  0.0253624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
128 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
206 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  39.34 
 
 
352 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
135 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 
148 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  42.37 
 
 
325 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 
156 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
196 aa  42  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1470  hypothetical protein  34.15 
 
 
191 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  31.86 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  31.3 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  34.25 
 
 
400 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  31.3 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
139 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  31.3 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  31.3 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  31.3 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
197 aa  41.2  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2744  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
151 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  40 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
143 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
213 aa  41.2  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
153 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  31.86 
 
 
334 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
237 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
181 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  29.23 
 
 
132 aa  40.8  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
340 aa  40.8  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  32.31 
 
 
178 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  42 
 
 
145 aa  40.8  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
288 aa  40.8  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.316655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>