More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0314 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03269  maltodextrin phosphorylase  64.09 
 
 
797 aa  1054    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000198557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  64.09 
 
 
797 aa  1054    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307375  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0519  glycogen phosphorylase  45.87 
 
 
813 aa  645    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3854  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.72 
 
 
829 aa  731    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  46.39 
 
 
836 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.25 
 
 
816 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4643  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.91 
 
 
815 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5966  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.04 
 
 
817 aa  693    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684528  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0067  glycogen phosphorylase  50.47 
 
 
832 aa  723    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  48.59 
 
 
836 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1446  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.36 
 
 
818 aa  685    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.48 
 
 
828 aa  721    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1594  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.71 
 
 
870 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0422  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.12 
 
 
816 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.879107  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3993  maltodextrin phosphorylase  69.1 
 
 
801 aa  1149    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0921  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.27 
 
 
839 aa  701    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0938734  normal  0.606568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3615  maltodextrin phosphorylase  64.09 
 
 
797 aa  1054    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3710  glycogen phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  671    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.30951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2508  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.73 
 
 
822 aa  686    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.372187  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18101  phosphorylase  44.35 
 
 
854 aa  677    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0130  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.92 
 
 
838 aa  666    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1176  phosphorylase  45.65 
 
 
839 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.4 
 
 
848 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.72 
 
 
808 aa  710    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1989  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.54 
 
 
848 aa  657    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  47.86 
 
 
837 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1204  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.73 
 
 
831 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3628  glycogen phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2115  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.79 
 
 
833 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3893  maltodextrin phosphorylase  64.09 
 
 
797 aa  1054    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1891  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.73 
 
 
842 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2288  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.59 
 
 
823 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.359184  hitchhiker  0.000599882 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0182  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.66 
 
 
840 aa  699    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0152  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.52 
 
 
840 aa  691    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.92 
 
 
838 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.96 
 
 
835 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.64 
 
 
834 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17931  phosphorylase  44.6 
 
 
848 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3088  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.04 
 
 
823 aa  680    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0284  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  668    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4002  glycogen phosphorylase  46.58 
 
 
815 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1693  phosphorylase  43.98 
 
 
848 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.19 
 
 
844 aa  683    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25951  phosphorylase  47.63 
 
 
841 aa  709    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.13 
 
 
826 aa  696    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2028  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.08 
 
 
844 aa  646    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550942  normal  0.926011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.38 
 
 
816 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.87 
 
 
841 aa  727    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3076  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.47 
 
 
840 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0428621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0844  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.51 
 
 
836 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.49 
 
 
807 aa  644    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7363  glycogen phosphorylase  46.07 
 
 
835 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221944  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6361  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.2 
 
 
832 aa  695    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196426  normal  0.63045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0511  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.36 
 
 
815 aa  651    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3790  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.38 
 
 
817 aa  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.727667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1322  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.46 
 
 
864 aa  690    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4861  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.68 
 
 
838 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.47 
 
 
846 aa  732    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.47 
 
 
846 aa  732    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  46.91 
 
 
817 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.39 
 
 
838 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1460  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.83 
 
 
831 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0151  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.44 
 
 
815 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3051  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.03 
 
 
894 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.501405  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17241  phosphorylase  45.83 
 
 
840 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44172  predicted protein  44.91 
 
 
876 aa  647    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.079411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  52.48 
 
 
831 aa  836    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20511  phosphorylase  45.65 
 
 
839 aa  681    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.694663  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3698  maltodextrin phosphorylase  64.09 
 
 
797 aa  1056    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.411664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5091  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.25 
 
 
816 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0161  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  69.1 
 
 
801 aa  1149    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.686596  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3907  glycogen phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0885  glycogen phosphorylase  45.04 
 
 
819 aa  648    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.93 
 
 
850 aa  729    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50 
 
 
849 aa  739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3798  maltodextrin phosphorylase  64.09 
 
 
797 aa  1039    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.910266  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4043  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.96 
 
 
859 aa  751    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.160668  normal  0.103786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4122  glycogen phosphorylase  46.44 
 
 
815 aa  677    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.942595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4636  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  69.1 
 
 
801 aa  1140    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04849  maltodextrin phosphorylase  51.99 
 
 
817 aa  850    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.85 
 
 
821 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  53.72 
 
 
817 aa  870    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17881  phosphorylase  44.84 
 
 
854 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.441746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.07 
 
 
832 aa  723    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.33 
 
 
838 aa  720    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  44.37 
 
 
829 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3435  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.33 
 
 
824 aa  651    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912321  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3896  glycogen phosphorylase  46.09 
 
 
815 aa  669    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.56 
 
 
827 aa  685    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.19 
 
 
833 aa  707    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.6 
 
 
829 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.79 
 
 
837 aa  700    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4429  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  48.17 
 
 
798 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3830  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  64.55 
 
 
797 aa  1046    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  64.09 
 
 
797 aa  1054    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0204899  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.63 
 
 
815 aa  661    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.9 
 
 
834 aa  782    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.13 
 
 
840 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>