More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2300 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
303 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.91 
 
 
308 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  57.19 
 
 
295 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  52.5 
 
 
285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  56.6 
 
 
416 aa  289  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  52.63 
 
 
401 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.26 
 
 
317 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  50.69 
 
 
471 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  49.82 
 
 
415 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.56 
 
 
293 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.06 
 
 
288 aa  275  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  53.82 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  50.36 
 
 
292 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.75 
 
 
295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  49.81 
 
 
272 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  50 
 
 
291 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  50.38 
 
 
269 aa  264  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  50.58 
 
 
302 aa  264  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  47.26 
 
 
341 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  51.81 
 
 
285 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46 
 
 
300 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  46.44 
 
 
301 aa  255  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  46.88 
 
 
288 aa  255  6e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  45.89 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  48.06 
 
 
284 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  51.9 
 
 
280 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  51 
 
 
297 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  50 
 
 
278 aa  249  4e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  47.02 
 
 
296 aa  249  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  50.84 
 
 
302 aa  248  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  49.61 
 
 
286 aa  248  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  44.11 
 
 
336 aa  247  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  49.8 
 
 
297 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  48.38 
 
 
281 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  54.27 
 
 
278 aa  243  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.92 
 
 
270 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  47.98 
 
 
265 aa  241  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  43.73 
 
 
330 aa  240  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  50.61 
 
 
304 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  49.62 
 
 
296 aa  237  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  50.85 
 
 
298 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  49.25 
 
 
298 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  47.39 
 
 
291 aa  235  8e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  52.94 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36005  predicted protein  45.3 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.275469 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  51.9 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  44.55 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.74 
 
 
269 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  46.59 
 
 
382 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  48.81 
 
 
336 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.46 
 
 
289 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  46.28 
 
 
370 aa  225  6e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.79 
 
 
298 aa  225  6e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  46.77 
 
 
373 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  47.18 
 
 
375 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.88 
 
 
287 aa  223  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  48.45 
 
 
347 aa  223  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  50.4 
 
 
360 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  46.77 
 
 
378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0594  chromosome partitioning ATPase protein-like  53.88 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  46.18 
 
 
353 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  47.06 
 
 
358 aa  221  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  46.9 
 
 
353 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.92 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  49.37 
 
 
363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  44.95 
 
 
351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.71 
 
 
289 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.53 
 
 
289 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  46.61 
 
 
374 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  48.19 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  49.39 
 
 
358 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  45.86 
 
 
356 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  48.12 
 
 
363 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  46.77 
 
 
374 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  44.28 
 
 
376 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11060  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor cfd1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C8Q1]  43.89 
 
 
334 aa  215  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.725803 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1878  NifH/FrxC domain-containing protein  43.22 
 
 
306 aa  215  8e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  45.04 
 
 
363 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  46.84 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  46.84 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.46 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  45.31 
 
 
364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.94 
 
 
367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  42.61 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  45.67 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  46.84 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.12 
 
 
362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1296  Mrp protein  46.07 
 
 
359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.27319  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  46.84 
 
 
395 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.08 
 
 
362 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  43.45 
 
 
379 aa  212  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  45.53 
 
 
379 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  46.34 
 
 
353 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  40.78 
 
 
302 aa  211  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  47.41 
 
 
354 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  43.06 
 
 
345 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  47.77 
 
 
367 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  45.15 
 
 
374 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  45.64 
 
 
371 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  45.64 
 
 
394 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>